Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CT47B1P0C2W7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CT47B1P0C2W7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CT47B1P0C2W7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CT47B1P0C2W7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CT47B1P0C2W7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CT47B1P0C2W7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CT47B1P0C2W7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CT47B1P0C2W7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CT47B1P0C2W7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CT47B1P0C2W7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CT47B1P0C2W7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CT47B1P0C2W7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CT47B1P0C2W7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CT47B1P0C2W7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CT47B1P0C2W7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CT47B1P0C2W7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CT47B1P0C2W7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CT47B1P0C2W7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CT47B1P0C2W7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CT47B1P0C2W7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CT47B1P0C2W7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CT47B1P0C2W7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CT47B1P0C2W7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CT47B1P0C2W7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CT47B1P0C2W7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CT47B1P0C2W7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CT47B1P0C2W7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CT47B1P0C2W7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CT47B1P0C2W7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CT47B1P0C2W7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CT47B1P0C2W7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CT47B1P0C2W7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CT47B1P0C2W7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CT47B1P0C2W7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CT47B1P0C2W7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CT47B1P0C2W7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CT47B1P0C2W7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CT47B1P0C2W7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CT47B1P0C2W7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CT47B1P0C2W7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CT47B1P0C2W7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CT47B1P0C2W7 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CT47B1P0C2W7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CT47B1P0C2W7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CT47B1P0C2W7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CT47B1P0C2W7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CT47B1P0C2W7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CT47B1P0C2W7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CT47B1P0C2W7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CT47B1P0C2W7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CT47B1P0C2W7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CT47B1P0C2W7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CT47B1P0C2W7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CT47B1P0C2W7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CT47B1P0C2W7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CT47B1P0C2W7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CT47B1P0C2W7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CT47B1P0C2W7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CT47B1P0C2W7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CT47B1P0C2W7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CT47B1P0C2W7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CT47B1P0C2W7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CT47B1P0C2W7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CT47B1P0C2W7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CT47B1P0C2W7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CT47B1P0C2W7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CT47B1P0C2W7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CT47B1P0C2W7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CT47B1P0C2W7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CT47B1P0C2W7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CT47B1P0C2W7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CT47B1P0C2W7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CT47B1P0C2W7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CT47B1P0C2W7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CT47B1P0C2W7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CT47B1P0C2W7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CT47B1P0C2W7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CT47B1P0C2W7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CT47B1P0C2W7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CT47B1P0C2W7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CT47B1P0C2W7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CT47B1P0C2W7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CT47B1P0C2W7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CT47B1P0C2W7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CT47B1P0C2W7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CT47B1P0C2W7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CT47B1P0C2W7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CT47B1P0C2W7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CT47B1P0C2W7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CT47B1P0C2W7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CT47B1P0C2W7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CT47B1P0C2W7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CT47B1P0C2W7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CT47B1P0C2W7 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CT47B1P0C2W7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CT47B1P0C2W7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CT47B1P0C2W7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CT47B1P0C2W7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CT47B1P0C2W7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms