Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOP08100 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOP08100 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOP08100 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOP08100 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOP08100 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOP08100 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOP08100 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOP08100 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOP08100 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOP08100 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOP08100 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOP08100 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOP08100 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOP08100 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOP08100 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOP08100 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOP08100 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOP08100 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOP08100 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOP08100 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOP08100 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOP08100 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOP08100 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOP08100 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOP08100 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOP08100 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOP08100 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOP08100 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RHOP08100 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOP08100 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOP08100 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOP08100 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOP08100 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOP08100 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOP08100 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOP08100 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOP08100 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOP08100 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOP08100 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOP08100 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOP08100 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOP08100 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHOP08100 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RHOP08100 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RHOP08100 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RHOP08100 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHOP08100 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHOP08100 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RHOP08100 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHOP08100 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RHOP08100 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHOP08100 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RHOP08100 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RHOP08100 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RHOP08100 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
RHOP08100 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RHOP08100 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RHOP08100 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOP08100 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOP08100 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOP08100 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOP08100 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOP08100 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOP08100 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOP08100 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOP08100 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOP08100 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOP08100 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOP08100 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOP08100 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOP08100 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOP08100 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOP08100 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOP08100 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOP08100 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHOP08100 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHOP08100 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHOP08100 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RHOP08100 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHOP08100 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHOP08100 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHOP08100 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHOP08100 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHOP08100 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHOP08100 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHOP08100 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHOP08100 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHOP08100 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHOP08100 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOP08100 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOP08100 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOP08100 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOP08100 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOP08100 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOP08100 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOP08100 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOP08100 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOP08100 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOP08100 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms