Protein–RNA interactions for Protein: P07195

LDHB, L-lactate dehydrogenase B chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHBP07195 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LDHBP07195 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LDHBP07195 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LDHBP07195 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LDHBP07195 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LDHBP07195 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LDHBP07195 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LDHBP07195 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LDHBP07195 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LDHBP07195 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LDHBP07195 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LDHBP07195 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LDHBP07195 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LDHBP07195 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LDHBP07195 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LDHBP07195 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LDHBP07195 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LDHBP07195 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LDHBP07195 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LDHBP07195 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LDHBP07195 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LDHBP07195 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LDHBP07195 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LDHBP07195 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
LDHBP07195 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LDHBP07195 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LDHBP07195 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LDHBP07195 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LDHBP07195 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LDHBP07195 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LDHBP07195 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LDHBP07195 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LDHBP07195 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LDHBP07195 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LDHBP07195 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LDHBP07195 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LDHBP07195 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LDHBP07195 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LDHBP07195 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LDHBP07195 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LDHBP07195 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LDHBP07195 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LDHBP07195 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LDHBP07195 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LDHBP07195 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LDHBP07195 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LDHBP07195 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LDHBP07195 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LDHBP07195 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LDHBP07195 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LDHBP07195 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LDHBP07195 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LDHBP07195 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LDHBP07195 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LDHBP07195 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LDHBP07195 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LDHBP07195 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LDHBP07195 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LDHBP07195 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LDHBP07195 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LDHBP07195 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LDHBP07195 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LDHBP07195 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LDHBP07195 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LDHBP07195 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LDHBP07195 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LDHBP07195 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LDHBP07195 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LDHBP07195 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LDHBP07195 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LDHBP07195 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LDHBP07195 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LDHBP07195 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LDHBP07195 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LDHBP07195 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LDHBP07195 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LDHBP07195 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LDHBP07195 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LDHBP07195 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LDHBP07195 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LDHBP07195 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LDHBP07195 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LDHBP07195 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LDHBP07195 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LDHBP07195 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LDHBP07195 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LDHBP07195 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LDHBP07195 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LDHBP07195 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LDHBP07195 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LDHBP07195 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LDHBP07195 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LDHBP07195 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LDHBP07195 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LDHBP07195 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LDHBP07195 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LDHBP07195 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LDHBP07195 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LDHBP07195 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LDHBP07195 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms