Protein–RNA interactions for Protein: P05423

POLR3D, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3DP05423 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR3DP05423 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR3DP05423 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms