Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYBBP04839 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYBBP04839 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYBBP04839 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYBBP04839 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYBBP04839 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYBBP04839 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYBBP04839 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYBBP04839 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYBBP04839 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYBBP04839 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYBBP04839 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYBBP04839 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYBBP04839 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CYBBP04839 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYBBP04839 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYBBP04839 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CYBBP04839 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CYBBP04839 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CYBBP04839 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CYBBP04839 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CYBBP04839 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYBBP04839 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYBBP04839 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYBBP04839 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYBBP04839 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYBBP04839 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYBBP04839 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYBBP04839 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYBBP04839 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYBBP04839 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYBBP04839 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYBBP04839 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYBBP04839 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYBBP04839 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYBBP04839 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYBBP04839 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYBBP04839 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYBBP04839 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYBBP04839 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYBBP04839 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYBBP04839 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYBBP04839 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYBBP04839 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYBBP04839 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYBBP04839 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYBBP04839 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYBBP04839 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYBBP04839 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYBBP04839 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYBBP04839 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYBBP04839 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYBBP04839 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYBBP04839 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYBBP04839 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYBBP04839 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYBBP04839 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYBBP04839 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYBBP04839 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYBBP04839 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYBBP04839 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYBBP04839 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYBBP04839 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYBBP04839 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYBBP04839 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYBBP04839 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYBBP04839 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYBBP04839 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYBBP04839 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYBBP04839 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYBBP04839 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYBBP04839 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYBBP04839 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYBBP04839 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYBBP04839 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYBBP04839 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYBBP04839 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYBBP04839 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYBBP04839 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYBBP04839 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYBBP04839 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYBBP04839 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYBBP04839 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYBBP04839 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CYBBP04839 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CYBBP04839 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CYBBP04839 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CYBBP04839 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CYBBP04839 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYBBP04839 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYBBP04839 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYBBP04839 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYBBP04839 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYBBP04839 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYBBP04839 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYBBP04839 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYBBP04839 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYBBP04839 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYBBP04839 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYBBP04839 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms