Protein–RNA interactions for Protein: P04554

PRM2, Protamine-2, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM2P04554 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRM2P04554 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRM2P04554 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRM2P04554 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRM2P04554 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRM2P04554 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRM2P04554 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRM2P04554 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRM2P04554 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRM2P04554 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRM2P04554 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRM2P04554 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRM2P04554 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRM2P04554 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRM2P04554 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRM2P04554 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRM2P04554 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRM2P04554 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRM2P04554 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRM2P04554 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRM2P04554 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRM2P04554 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRM2P04554 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRM2P04554 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRM2P04554 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRM2P04554 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRM2P04554 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRM2P04554 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRM2P04554 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRM2P04554 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRM2P04554 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PRM2P04554 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRM2P04554 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRM2P04554 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRM2P04554 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRM2P04554 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRM2P04554 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRM2P04554 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRM2P04554 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRM2P04554 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRM2P04554 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRM2P04554 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRM2P04554 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRM2P04554 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRM2P04554 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRM2P04554 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRM2P04554 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRM2P04554 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRM2P04554 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRM2P04554 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRM2P04554 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRM2P04554 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRM2P04554 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PRM2P04554 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRM2P04554 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRM2P04554 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRM2P04554 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRM2P04554 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRM2P04554 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRM2P04554 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRM2P04554 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRM2P04554 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRM2P04554 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRM2P04554 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRM2P04554 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRM2P04554 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRM2P04554 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PRM2P04554 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRM2P04554 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRM2P04554 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRM2P04554 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRM2P04554 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRM2P04554 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRM2P04554 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRM2P04554 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRM2P04554 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRM2P04554 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRM2P04554 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRM2P04554 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRM2P04554 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRM2P04554 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRM2P04554 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRM2P04554 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRM2P04554 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRM2P04554 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRM2P04554 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRM2P04554 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRM2P04554 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRM2P04554 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRM2P04554 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRM2P04554 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRM2P04554 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRM2P04554 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRM2P04554 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRM2P04554 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRM2P04554 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRM2P04554 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRM2P04554 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRM2P04554 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRM2P04554 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms