Protein–RNA interactions for Protein: P02679

FGG, Fibrinogen gamma chain, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGGP02679 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGGP02679 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGGP02679 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FGGP02679 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGGP02679 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FGGP02679 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FGGP02679 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FGGP02679 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FGGP02679 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGGP02679 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGGP02679 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGGP02679 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGGP02679 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGGP02679 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGGP02679 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FGGP02679 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGGP02679 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGGP02679 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGGP02679 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGGP02679 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGGP02679 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGGP02679 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGGP02679 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGGP02679 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGGP02679 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGGP02679 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGGP02679 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGGP02679 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGGP02679 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FGGP02679 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGGP02679 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGGP02679 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGGP02679 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGGP02679 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGGP02679 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGGP02679 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGGP02679 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGGP02679 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGGP02679 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGGP02679 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGGP02679 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGGP02679 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGGP02679 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGGP02679 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGGP02679 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FGGP02679 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGGP02679 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGGP02679 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGGP02679 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGGP02679 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGGP02679 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGGP02679 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGGP02679 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGGP02679 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGGP02679 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGGP02679 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGGP02679 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGGP02679 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGGP02679 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGGP02679 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FGGP02679 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGGP02679 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGGP02679 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGGP02679 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGGP02679 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGGP02679 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGGP02679 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGGP02679 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGGP02679 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGGP02679 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGGP02679 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGGP02679 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGGP02679 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGGP02679 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGGP02679 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGGP02679 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGGP02679 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGGP02679 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGGP02679 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGGP02679 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGGP02679 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGGP02679 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGGP02679 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGGP02679 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGGP02679 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGGP02679 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGGP02679 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGGP02679 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGGP02679 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGGP02679 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGGP02679 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGGP02679 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FGGP02679 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGGP02679 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGGP02679 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGGP02679 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FGGP02679 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGGP02679 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGGP02679 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGGP02679 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms