Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GABARAPO95166 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GABARAPO95166 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GABARAPO95166 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GABARAPO95166 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GABARAPO95166 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GABARAPO95166 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GABARAPO95166 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GABARAPO95166 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms