Protein–RNA interactions for Protein: O75691

UTP20, Small subunit processome component 20 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP20O75691 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UTP20O75691 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UTP20O75691 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
UTP20O75691 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
UTP20O75691 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
UTP20O75691 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
UTP20O75691 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
UTP20O75691 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
UTP20O75691 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP20O75691 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP20O75691 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP20O75691 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP20O75691 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP20O75691 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP20O75691 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP20O75691 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP20O75691 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP20O75691 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP20O75691 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP20O75691 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP20O75691 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP20O75691 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP20O75691 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP20O75691 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP20O75691 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP20O75691 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP20O75691 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP20O75691 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP20O75691 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP20O75691 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP20O75691 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP20O75691 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP20O75691 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP20O75691 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP20O75691 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UTP20O75691 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UTP20O75691 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
UTP20O75691 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UTP20O75691 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UTP20O75691 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UTP20O75691 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
UTP20O75691 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
UTP20O75691 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UTP20O75691 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UTP20O75691 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UTP20O75691 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UTP20O75691 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UTP20O75691 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UTP20O75691 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UTP20O75691 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UTP20O75691 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UTP20O75691 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UTP20O75691 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UTP20O75691 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UTP20O75691 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UTP20O75691 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UTP20O75691 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UTP20O75691 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UTP20O75691 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UTP20O75691 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UTP20O75691 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UTP20O75691 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UTP20O75691 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UTP20O75691 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UTP20O75691 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
UTP20O75691 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTP20O75691 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTP20O75691 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTP20O75691 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTP20O75691 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTP20O75691 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTP20O75691 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
UTP20O75691 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTP20O75691 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTP20O75691 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTP20O75691 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
UTP20O75691 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTP20O75691 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTP20O75691 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTP20O75691 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UTP20O75691 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTP20O75691 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTP20O75691 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTP20O75691 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTP20O75691 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTP20O75691 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTP20O75691 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
UTP20O75691 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTP20O75691 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTP20O75691 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTP20O75691 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTP20O75691 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTP20O75691 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTP20O75691 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTP20O75691 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTP20O75691 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTP20O75691 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTP20O75691 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTP20O75691 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTP20O75691 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms