Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRMUO75648 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRMUO75648 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRMUO75648 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRMUO75648 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRMUO75648 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRMUO75648 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRMUO75648 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TRMUO75648 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRMUO75648 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRMUO75648 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRMUO75648 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRMUO75648 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRMUO75648 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRMUO75648 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRMUO75648 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRMUO75648 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRMUO75648 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRMUO75648 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRMUO75648 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRMUO75648 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRMUO75648 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRMUO75648 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRMUO75648 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRMUO75648 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRMUO75648 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRMUO75648 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRMUO75648 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRMUO75648 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRMUO75648 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRMUO75648 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRMUO75648 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRMUO75648 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRMUO75648 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRMUO75648 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRMUO75648 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRMUO75648 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRMUO75648 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRMUO75648 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRMUO75648 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TRMUO75648 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TRMUO75648 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRMUO75648 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRMUO75648 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRMUO75648 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRMUO75648 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRMUO75648 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRMUO75648 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRMUO75648 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRMUO75648 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRMUO75648 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRMUO75648 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TRMUO75648 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRMUO75648 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TRMUO75648 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRMUO75648 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRMUO75648 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRMUO75648 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRMUO75648 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRMUO75648 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRMUO75648 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRMUO75648 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRMUO75648 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRMUO75648 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRMUO75648 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRMUO75648 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRMUO75648 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRMUO75648 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRMUO75648 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRMUO75648 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRMUO75648 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRMUO75648 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRMUO75648 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRMUO75648 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRMUO75648 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRMUO75648 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRMUO75648 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRMUO75648 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRMUO75648 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRMUO75648 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRMUO75648 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRMUO75648 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRMUO75648 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRMUO75648 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRMUO75648 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRMUO75648 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRMUO75648 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRMUO75648 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRMUO75648 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRMUO75648 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRMUO75648 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TRMUO75648 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRMUO75648 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRMUO75648 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRMUO75648 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRMUO75648 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRMUO75648 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRMUO75648 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRMUO75648 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRMUO75648 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms