Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms