Protein–RNA interactions for Protein: O75293

GADD45B, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45BO75293 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GADD45BO75293 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GADD45BO75293 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GADD45BO75293 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GADD45BO75293 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GADD45BO75293 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GADD45BO75293 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GADD45BO75293 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GADD45BO75293 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GADD45BO75293 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GADD45BO75293 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GADD45BO75293 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GADD45BO75293 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GADD45BO75293 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GADD45BO75293 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GADD45BO75293 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GADD45BO75293 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GADD45BO75293 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GADD45BO75293 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GADD45BO75293 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GADD45BO75293 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GADD45BO75293 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GADD45BO75293 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GADD45BO75293 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GADD45BO75293 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GADD45BO75293 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GADD45BO75293 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GADD45BO75293 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GADD45BO75293 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GADD45BO75293 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GADD45BO75293 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GADD45BO75293 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GADD45BO75293 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GADD45BO75293 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GADD45BO75293 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GADD45BO75293 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GADD45BO75293 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GADD45BO75293 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GADD45BO75293 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GADD45BO75293 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GADD45BO75293 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GADD45BO75293 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GADD45BO75293 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GADD45BO75293 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GADD45BO75293 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GADD45BO75293 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GADD45BO75293 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GADD45BO75293 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GADD45BO75293 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GADD45BO75293 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GADD45BO75293 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GADD45BO75293 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GADD45BO75293 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GADD45BO75293 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GADD45BO75293 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GADD45BO75293 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GADD45BO75293 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GADD45BO75293 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GADD45BO75293 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GADD45BO75293 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GADD45BO75293 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GADD45BO75293 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GADD45BO75293 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GADD45BO75293 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GADD45BO75293 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GADD45BO75293 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GADD45BO75293 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GADD45BO75293 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GADD45BO75293 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GADD45BO75293 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GADD45BO75293 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GADD45BO75293 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GADD45BO75293 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GADD45BO75293 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GADD45BO75293 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GADD45BO75293 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GADD45BO75293 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GADD45BO75293 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GADD45BO75293 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GADD45BO75293 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GADD45BO75293 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GADD45BO75293 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GADD45BO75293 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GADD45BO75293 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GADD45BO75293 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GADD45BO75293 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GADD45BO75293 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GADD45BO75293 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GADD45BO75293 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GADD45BO75293 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GADD45BO75293 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GADD45BO75293 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GADD45BO75293 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GADD45BO75293 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GADD45BO75293 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GADD45BO75293 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GADD45BO75293 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GADD45BO75293 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GADD45BO75293 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms