Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPFIA3O75145 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPFIA3O75145 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPFIA3O75145 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPFIA3O75145 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPFIA3O75145 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPFIA3O75145 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPFIA3O75145 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPFIA3O75145 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPFIA3O75145 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PPFIA3O75145 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
PPFIA3O75145 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms