Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG13O75143 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG13O75143 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG13O75143 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG13O75143 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG13O75143 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG13O75143 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG13O75143 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG13O75143 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG13O75143 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG13O75143 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG13O75143 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG13O75143 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG13O75143 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG13O75143 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG13O75143 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG13O75143 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG13O75143 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG13O75143 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG13O75143 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG13O75143 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG13O75143 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG13O75143 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG13O75143 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG13O75143 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG13O75143 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG13O75143 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG13O75143 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG13O75143 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG13O75143 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG13O75143 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG13O75143 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG13O75143 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG13O75143 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG13O75143 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG13O75143 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG13O75143 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG13O75143 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG13O75143 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG13O75143 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG13O75143 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG13O75143 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG13O75143 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG13O75143 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG13O75143 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG13O75143 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG13O75143 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG13O75143 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG13O75143 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG13O75143 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG13O75143 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG13O75143 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG13O75143 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG13O75143 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG13O75143 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG13O75143 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG13O75143 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG13O75143 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG13O75143 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG13O75143 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG13O75143 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG13O75143 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG13O75143 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG13O75143 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG13O75143 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG13O75143 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG13O75143 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG13O75143 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG13O75143 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG13O75143 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG13O75143 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG13O75143 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATG13O75143 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATG13O75143 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG13O75143 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG13O75143 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG13O75143 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG13O75143 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG13O75143 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG13O75143 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG13O75143 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG13O75143 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG13O75143 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG13O75143 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG13O75143 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG13O75143 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG13O75143 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG13O75143 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG13O75143 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG13O75143 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG13O75143 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG13O75143 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG13O75143 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG13O75143 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG13O75143 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG13O75143 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG13O75143 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG13O75143 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG13O75143 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG13O75143 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms