Protein–RNA interactions for Protein: O60337

MARCH6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH6O60337 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MARCH6O60337 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms