Protein–RNA interactions for Protein: O43813

LANCL1, LanC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LANCL1O43813 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms