Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CRXO43186 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRXO43186 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRXO43186 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRXO43186 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRXO43186 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRXO43186 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CRXO43186 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRXO43186 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CRXO43186 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRXO43186 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRXO43186 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRXO43186 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRXO43186 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRXO43186 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CRXO43186 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CRXO43186 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CRXO43186 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CRXO43186 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRXO43186 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRXO43186 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRXO43186 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRXO43186 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRXO43186 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRXO43186 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRXO43186 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRXO43186 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CRXO43186 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRXO43186 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRXO43186 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CRXO43186 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRXO43186 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRXO43186 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRXO43186 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRXO43186 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRXO43186 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRXO43186 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRXO43186 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRXO43186 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRXO43186 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRXO43186 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRXO43186 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRXO43186 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRXO43186 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CRXO43186 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRXO43186 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CRXO43186 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CRXO43186 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRXO43186 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRXO43186 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRXO43186 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRXO43186 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CRXO43186 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRXO43186 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRXO43186 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRXO43186 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRXO43186 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRXO43186 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRXO43186 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRXO43186 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRXO43186 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CRXO43186 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRXO43186 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRXO43186 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRXO43186 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRXO43186 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRXO43186 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRXO43186 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CRXO43186 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRXO43186 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRXO43186 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRXO43186 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRXO43186 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRXO43186 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRXO43186 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRXO43186 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRXO43186 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRXO43186 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRXO43186 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRXO43186 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRXO43186 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRXO43186 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRXO43186 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRXO43186 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRXO43186 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRXO43186 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRXO43186 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRXO43186 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRXO43186 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRXO43186 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRXO43186 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRXO43186 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRXO43186 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRXO43186 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRXO43186 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRXO43186 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRXO43186 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRXO43186 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRXO43186 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRXO43186 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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