Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBDO15205 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
UBDO15205 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBDO15205 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBDO15205 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBDO15205 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBDO15205 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBDO15205 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBDO15205 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBDO15205 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBDO15205 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBDO15205 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBDO15205 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBDO15205 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBDO15205 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBDO15205 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBDO15205 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBDO15205 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBDO15205 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBDO15205 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBDO15205 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBDO15205 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBDO15205 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
UBDO15205 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBDO15205 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBDO15205 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBDO15205 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
UBDO15205 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBDO15205 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBDO15205 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBDO15205 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBDO15205 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBDO15205 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBDO15205 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBDO15205 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBDO15205 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBDO15205 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBDO15205 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBDO15205 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBDO15205 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
UBDO15205 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBDO15205 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBDO15205 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBDO15205 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBDO15205 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBDO15205 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBDO15205 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBDO15205 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBDO15205 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBDO15205 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBDO15205 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBDO15205 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBDO15205 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBDO15205 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBDO15205 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBDO15205 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
UBDO15205 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
UBDO15205 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
UBDO15205 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
UBDO15205 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
UBDO15205 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBDO15205 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBDO15205 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBDO15205 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBDO15205 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBDO15205 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBDO15205 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
UBDO15205 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBDO15205 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBDO15205 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBDO15205 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBDO15205 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBDO15205 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBDO15205 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBDO15205 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBDO15205 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBDO15205 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBDO15205 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBDO15205 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBDO15205 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBDO15205 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBDO15205 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBDO15205 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBDO15205 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBDO15205 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBDO15205 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBDO15205 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBDO15205 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBDO15205 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBDO15205 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBDO15205 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBDO15205 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBDO15205 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBDO15205 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBDO15205 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBDO15205 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBDO15205 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBDO15205 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBDO15205 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBDO15205 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms