Protein–RNA interactions for Protein: O15197

EPHB6, Ephrin type-B receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB6O15197 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHB6O15197 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHB6O15197 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHB6O15197 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHB6O15197 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHB6O15197 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHB6O15197 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHB6O15197 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHB6O15197 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHB6O15197 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHB6O15197 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHB6O15197 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHB6O15197 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHB6O15197 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHB6O15197 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHB6O15197 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHB6O15197 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHB6O15197 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHB6O15197 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHB6O15197 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHB6O15197 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHB6O15197 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHB6O15197 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHB6O15197 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHB6O15197 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHB6O15197 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHB6O15197 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHB6O15197 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHB6O15197 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHB6O15197 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHB6O15197 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHB6O15197 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHB6O15197 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHB6O15197 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHB6O15197 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHB6O15197 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHB6O15197 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHB6O15197 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHB6O15197 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHB6O15197 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHB6O15197 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHB6O15197 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHB6O15197 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHB6O15197 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHB6O15197 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHB6O15197 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHB6O15197 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHB6O15197 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHB6O15197 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHB6O15197 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHB6O15197 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHB6O15197 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
EPHB6O15197 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPHB6O15197 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPHB6O15197 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPHB6O15197 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPHB6O15197 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPHB6O15197 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
EPHB6O15197 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPHB6O15197 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
EPHB6O15197 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
EPHB6O15197 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
EPHB6O15197 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHB6O15197 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHB6O15197 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHB6O15197 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHB6O15197 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHB6O15197 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHB6O15197 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHB6O15197 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHB6O15197 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHB6O15197 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHB6O15197 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHB6O15197 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHB6O15197 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHB6O15197 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHB6O15197 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHB6O15197 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHB6O15197 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHB6O15197 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHB6O15197 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHB6O15197 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHB6O15197 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHB6O15197 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHB6O15197 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHB6O15197 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHB6O15197 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHB6O15197 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHB6O15197 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHB6O15197 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHB6O15197 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHB6O15197 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHB6O15197 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHB6O15197 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHB6O15197 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHB6O15197 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHB6O15197 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHB6O15197 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHB6O15197 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHB6O15197 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms