Protein–RNA interactions for Protein: O15194

CTDSPL, CTD small phosphatase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPLO15194 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSPLO15194 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSPLO15194 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSPLO15194 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSPLO15194 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSPLO15194 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSPLO15194 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSPLO15194 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSPLO15194 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSPLO15194 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSPLO15194 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSPLO15194 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSPLO15194 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSPLO15194 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSPLO15194 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSPLO15194 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSPLO15194 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSPLO15194 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSPLO15194 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSPLO15194 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSPLO15194 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSPLO15194 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSPLO15194 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSPLO15194 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSPLO15194 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSPLO15194 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSPLO15194 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSPLO15194 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSPLO15194 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSPLO15194 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSPLO15194 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSPLO15194 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSPLO15194 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSPLO15194 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSPLO15194 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSPLO15194 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSPLO15194 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSPLO15194 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSPLO15194 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSPLO15194 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSPLO15194 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSPLO15194 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSPLO15194 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSPLO15194 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSPLO15194 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSPLO15194 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSPLO15194 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSPLO15194 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSPLO15194 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSPLO15194 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSPLO15194 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSPLO15194 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSPLO15194 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSPLO15194 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSPLO15194 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSPLO15194 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTDSPLO15194 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTDSPLO15194 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CTDSPLO15194 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTDSPLO15194 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTDSPLO15194 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTDSPLO15194 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTDSPLO15194 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTDSPLO15194 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTDSPLO15194 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTDSPLO15194 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTDSPLO15194 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTDSPLO15194 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTDSPLO15194 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTDSPLO15194 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTDSPLO15194 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTDSPLO15194 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTDSPLO15194 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTDSPLO15194 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSPLO15194 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSPLO15194 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSPLO15194 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSPLO15194 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSPLO15194 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSPLO15194 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSPLO15194 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSPLO15194 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSPLO15194 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSPLO15194 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSPLO15194 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSPLO15194 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSPLO15194 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSPLO15194 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSPLO15194 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSPLO15194 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSPLO15194 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSPLO15194 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSPLO15194 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSPLO15194 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSPLO15194 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSPLO15194 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSPLO15194 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSPLO15194 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSPLO15194 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSPLO15194 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms