Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms