Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CLGNO14967 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CLGNO14967 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CLGNO14967 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CLGNO14967 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CLGNO14967 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CLGNO14967 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CLGNO14967 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CLGNO14967 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLGNO14967 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLGNO14967 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLGNO14967 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLGNO14967 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CLGNO14967 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLGNO14967 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLGNO14967 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLGNO14967 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLGNO14967 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLGNO14967 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLGNO14967 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLGNO14967 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLGNO14967 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLGNO14967 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLGNO14967 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLGNO14967 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLGNO14967 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLGNO14967 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLGNO14967 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLGNO14967 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLGNO14967 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLGNO14967 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLGNO14967 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLGNO14967 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLGNO14967 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLGNO14967 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLGNO14967 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLGNO14967 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLGNO14967 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLGNO14967 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLGNO14967 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLGNO14967 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLGNO14967 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLGNO14967 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLGNO14967 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLGNO14967 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLGNO14967 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CLGNO14967 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLGNO14967 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLGNO14967 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLGNO14967 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLGNO14967 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLGNO14967 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLGNO14967 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLGNO14967 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLGNO14967 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLGNO14967 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLGNO14967 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLGNO14967 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLGNO14967 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLGNO14967 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLGNO14967 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLGNO14967 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLGNO14967 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLGNO14967 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLGNO14967 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLGNO14967 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLGNO14967 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CLGNO14967 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLGNO14967 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLGNO14967 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLGNO14967 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLGNO14967 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLGNO14967 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLGNO14967 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLGNO14967 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLGNO14967 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLGNO14967 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLGNO14967 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLGNO14967 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLGNO14967 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLGNO14967 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLGNO14967 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLGNO14967 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLGNO14967 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLGNO14967 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLGNO14967 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLGNO14967 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CLGNO14967 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CLGNO14967 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CLGNO14967 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLGNO14967 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLGNO14967 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLGNO14967 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLGNO14967 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLGNO14967 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLGNO14967 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLGNO14967 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLGNO14967 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLGNO14967 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CLGNO14967 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms