Protein–RNA interactions for Protein: O14879

IFIT3, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIT3O14879 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
IFIT3O14879 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
IFIT3O14879 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
IFIT3O14879 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
IFIT3O14879 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
IFIT3O14879 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFIT3O14879 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFIT3O14879 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFIT3O14879 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFIT3O14879 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFIT3O14879 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFIT3O14879 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFIT3O14879 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFIT3O14879 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFIT3O14879 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFIT3O14879 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFIT3O14879 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFIT3O14879 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFIT3O14879 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFIT3O14879 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFIT3O14879 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFIT3O14879 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFIT3O14879 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFIT3O14879 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
IFIT3O14879 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFIT3O14879 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFIT3O14879 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFIT3O14879 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFIT3O14879 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFIT3O14879 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFIT3O14879 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFIT3O14879 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFIT3O14879 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFIT3O14879 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFIT3O14879 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFIT3O14879 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFIT3O14879 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFIT3O14879 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFIT3O14879 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFIT3O14879 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFIT3O14879 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFIT3O14879 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFIT3O14879 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFIT3O14879 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFIT3O14879 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFIT3O14879 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFIT3O14879 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFIT3O14879 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFIT3O14879 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFIT3O14879 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFIT3O14879 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFIT3O14879 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFIT3O14879 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFIT3O14879 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFIT3O14879 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFIT3O14879 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFIT3O14879 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFIT3O14879 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFIT3O14879 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFIT3O14879 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFIT3O14879 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFIT3O14879 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFIT3O14879 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFIT3O14879 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFIT3O14879 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFIT3O14879 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFIT3O14879 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFIT3O14879 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFIT3O14879 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFIT3O14879 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFIT3O14879 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFIT3O14879 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFIT3O14879 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFIT3O14879 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFIT3O14879 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFIT3O14879 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFIT3O14879 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFIT3O14879 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFIT3O14879 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFIT3O14879 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFIT3O14879 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFIT3O14879 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFIT3O14879 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFIT3O14879 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFIT3O14879 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFIT3O14879 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFIT3O14879 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
IFIT3O14879 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms