Protein–RNA interactions for Protein: O14815

CAPN9, Calpain-9, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN9O14815 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN9O14815 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN9O14815 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN9O14815 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN9O14815 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN9O14815 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN9O14815 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN9O14815 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN9O14815 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN9O14815 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN9O14815 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN9O14815 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN9O14815 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN9O14815 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN9O14815 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN9O14815 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN9O14815 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN9O14815 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN9O14815 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN9O14815 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN9O14815 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN9O14815 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN9O14815 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN9O14815 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN9O14815 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN9O14815 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN9O14815 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN9O14815 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN9O14815 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN9O14815 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN9O14815 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN9O14815 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN9O14815 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN9O14815 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN9O14815 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN9O14815 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN9O14815 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN9O14815 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN9O14815 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms