Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
E9PBE3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
E9PBE3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
E9PBE3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E9PBE3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E9PBE3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
E9PBE3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E9PBE3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
E9PBE3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
E9PBE3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
E9PBE3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
E9PBE3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
E9PBE3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
E9PBE3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
E9PBE3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
E9PBE3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
E9PBE3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
E9PBE3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E9PBE3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
E9PBE3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
E9PBE3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
E9PBE3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
E9PBE3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
E9PBE3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
E9PBE3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
E9PBE3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
E9PBE3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
E9PBE3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
E9PBE3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
E9PBE3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
E9PBE3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E9PBE3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E9PBE3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E9PBE3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E9PBE3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
E9PBE3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E9PBE3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E9PBE3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E9PBE3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E9PBE3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E9PBE3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
E9PBE3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
E9PBE3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
E9PBE3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
E9PBE3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E9PBE3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E9PBE3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
E9PBE3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
E9PBE3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
E9PBE3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
E9PBE3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
E9PBE3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
E9PBE3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
E9PBE3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
E9PBE3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
E9PBE3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
E9PBE3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
E9PBE3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
E9PBE3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
E9PBE3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
E9PBE3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
E9PBE3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
E9PBE3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E9PBE3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
E9PBE3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
E9PBE3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E9PBE3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
E9PBE3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E9PBE3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E9PBE3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
E9PBE3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
E9PBE3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E9PBE3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E9PBE3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E9PBE3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
E9PBE3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E9PBE3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E9PBE3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E9PBE3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
E9PBE3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
E9PBE3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
E9PBE3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
E9PBE3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
E9PBE3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
E9PBE3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
E9PBE3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
E9PBE3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
E9PBE3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
E9PBE3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
E9PBE3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
E9PBE3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
E9PBE3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
E9PBE3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
E9PBE3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
E9PBE3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
E9PBE3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
E9PBE3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
E9PBE3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
E9PBE3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
E9PBE3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms