Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms