Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CLDN25C9JDP6 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLDN25C9JDP6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLDN25C9JDP6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLDN25C9JDP6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLDN25C9JDP6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLDN25C9JDP6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLDN25C9JDP6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLDN25C9JDP6 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms