Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERVV-1B6SEH8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERVV-1B6SEH8 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERVV-1B6SEH8 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERVV-1B6SEH8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERVV-1B6SEH8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERVV-1B6SEH8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERVV-1B6SEH8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERVV-1B6SEH8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERVV-1B6SEH8 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ERVV-1B6SEH8 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERVV-1B6SEH8 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERVV-1B6SEH8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERVV-1B6SEH8 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERVV-1B6SEH8 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERVV-1B6SEH8 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERVV-1B6SEH8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERVV-1B6SEH8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERVV-1B6SEH8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERVV-1B6SEH8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ERVV-1B6SEH8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ERVV-1B6SEH8 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ERVV-1B6SEH8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ERVV-1B6SEH8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ERVV-1B6SEH8 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ERVV-1B6SEH8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ERVV-1B6SEH8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ERVV-1B6SEH8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ERVV-1B6SEH8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ERVV-1B6SEH8 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ERVV-1B6SEH8 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ERVV-1B6SEH8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ERVV-1B6SEH8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ERVV-1B6SEH8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ERVV-1B6SEH8 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ERVV-1B6SEH8 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ERVV-1B6SEH8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ERVV-1B6SEH8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ERVV-1B6SEH8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERVV-1B6SEH8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERVV-1B6SEH8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERVV-1B6SEH8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERVV-1B6SEH8 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERVV-1B6SEH8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERVV-1B6SEH8 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERVV-1B6SEH8 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERVV-1B6SEH8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ERVV-1B6SEH8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERVV-1B6SEH8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERVV-1B6SEH8 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERVV-1B6SEH8 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERVV-1B6SEH8 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERVV-1B6SEH8 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERVV-1B6SEH8 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERVV-1B6SEH8 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ERVV-1B6SEH8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERVV-1B6SEH8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERVV-1B6SEH8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERVV-1B6SEH8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERVV-1B6SEH8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERVV-1B6SEH8 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERVV-1B6SEH8 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERVV-1B6SEH8 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ERVV-1B6SEH8 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERVV-1B6SEH8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERVV-1B6SEH8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERVV-1B6SEH8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERVV-1B6SEH8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERVV-1B6SEH8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERVV-1B6SEH8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERVV-1B6SEH8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERVV-1B6SEH8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERVV-1B6SEH8 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERVV-1B6SEH8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERVV-1B6SEH8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERVV-1B6SEH8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERVV-1B6SEH8 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ERVV-1B6SEH8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERVV-1B6SEH8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERVV-1B6SEH8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERVV-1B6SEH8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERVV-1B6SEH8 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERVV-1B6SEH8 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERVV-1B6SEH8 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERVV-1B6SEH8 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERVV-1B6SEH8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERVV-1B6SEH8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERVV-1B6SEH8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERVV-1B6SEH8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERVV-1B6SEH8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERVV-1B6SEH8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERVV-1B6SEH8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERVV-1B6SEH8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERVV-1B6SEH8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERVV-1B6SEH8 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERVV-1B6SEH8 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERVV-1B6SEH8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERVV-1B6SEH8 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERVV-1B6SEH8 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms