Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
ZNF879B4DU55 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF879B4DU55 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF879B4DU55 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF879B4DU55 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF879B4DU55 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF879B4DU55 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF879B4DU55 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF879B4DU55 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF879B4DU55 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF879B4DU55 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF879B4DU55 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF879B4DU55 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF879B4DU55 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF879B4DU55 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF879B4DU55 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF879B4DU55 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF879B4DU55 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF879B4DU55 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF879B4DU55 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF879B4DU55 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF879B4DU55 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF879B4DU55 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF879B4DU55 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF879B4DU55 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF879B4DU55 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF879B4DU55 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF879B4DU55 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF879B4DU55 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF879B4DU55 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF879B4DU55 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF879B4DU55 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF879B4DU55 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF879B4DU55 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF879B4DU55 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms