Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
HMGB1P1B2RPK0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms