Protein–RNA interactions for Protein: A8K8P3

SFI1, Protein SFI1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFI1A8K8P3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SFI1A8K8P3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SFI1A8K8P3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SFI1A8K8P3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SFI1A8K8P3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SFI1A8K8P3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SFI1A8K8P3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SFI1A8K8P3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SFI1A8K8P3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SFI1A8K8P3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SFI1A8K8P3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SFI1A8K8P3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SFI1A8K8P3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SFI1A8K8P3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SFI1A8K8P3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SFI1A8K8P3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SFI1A8K8P3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SFI1A8K8P3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SFI1A8K8P3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SFI1A8K8P3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SFI1A8K8P3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SFI1A8K8P3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SFI1A8K8P3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SFI1A8K8P3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SFI1A8K8P3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SFI1A8K8P3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SFI1A8K8P3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SFI1A8K8P3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SFI1A8K8P3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SFI1A8K8P3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SFI1A8K8P3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SFI1A8K8P3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SFI1A8K8P3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SFI1A8K8P3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SFI1A8K8P3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFI1A8K8P3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFI1A8K8P3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFI1A8K8P3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFI1A8K8P3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFI1A8K8P3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFI1A8K8P3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFI1A8K8P3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SFI1A8K8P3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFI1A8K8P3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SFI1A8K8P3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFI1A8K8P3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFI1A8K8P3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFI1A8K8P3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFI1A8K8P3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFI1A8K8P3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFI1A8K8P3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFI1A8K8P3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFI1A8K8P3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFI1A8K8P3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFI1A8K8P3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFI1A8K8P3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFI1A8K8P3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFI1A8K8P3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFI1A8K8P3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFI1A8K8P3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFI1A8K8P3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFI1A8K8P3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFI1A8K8P3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFI1A8K8P3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFI1A8K8P3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFI1A8K8P3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFI1A8K8P3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFI1A8K8P3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFI1A8K8P3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFI1A8K8P3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFI1A8K8P3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFI1A8K8P3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFI1A8K8P3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFI1A8K8P3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFI1A8K8P3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFI1A8K8P3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFI1A8K8P3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFI1A8K8P3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFI1A8K8P3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFI1A8K8P3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFI1A8K8P3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFI1A8K8P3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFI1A8K8P3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SFI1A8K8P3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SFI1A8K8P3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SFI1A8K8P3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SFI1A8K8P3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SFI1A8K8P3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SFI1A8K8P3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SFI1A8K8P3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SFI1A8K8P3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SFI1A8K8P3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SFI1A8K8P3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFI1A8K8P3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFI1A8K8P3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFI1A8K8P3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFI1A8K8P3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFI1A8K8P3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SFI1A8K8P3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SFI1A8K8P3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms