Protein–RNA interactions for Protein: A6NNY8

USP27X, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27XA6NNY8 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms