Protein–RNA interactions for Protein: A6NKL6

TMEM200C, Transmembrane protein 200C, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200CA6NKL6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM200CA6NKL6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM200CA6NKL6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM200CA6NKL6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM200CA6NKL6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM200CA6NKL6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM200CA6NKL6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM200CA6NKL6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM200CA6NKL6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM200CA6NKL6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM200CA6NKL6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM200CA6NKL6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM200CA6NKL6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM200CA6NKL6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM200CA6NKL6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM200CA6NKL6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM200CA6NKL6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM200CA6NKL6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM200CA6NKL6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM200CA6NKL6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM200CA6NKL6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM200CA6NKL6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM200CA6NKL6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM200CA6NKL6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM200CA6NKL6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM200CA6NKL6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM200CA6NKL6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM200CA6NKL6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM200CA6NKL6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM200CA6NKL6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM200CA6NKL6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM200CA6NKL6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM200CA6NKL6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM200CA6NKL6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM200CA6NKL6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM200CA6NKL6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM200CA6NKL6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM200CA6NKL6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM200CA6NKL6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM200CA6NKL6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMEM200CA6NKL6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMEM200CA6NKL6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMEM200CA6NKL6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMEM200CA6NKL6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMEM200CA6NKL6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMEM200CA6NKL6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM200CA6NKL6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM200CA6NKL6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM200CA6NKL6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM200CA6NKL6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM200CA6NKL6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM200CA6NKL6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM200CA6NKL6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM200CA6NKL6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM200CA6NKL6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM200CA6NKL6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM200CA6NKL6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM200CA6NKL6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM200CA6NKL6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM200CA6NKL6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM200CA6NKL6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM200CA6NKL6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM200CA6NKL6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM200CA6NKL6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM200CA6NKL6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM200CA6NKL6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM200CA6NKL6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM200CA6NKL6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM200CA6NKL6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM200CA6NKL6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM200CA6NKL6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM200CA6NKL6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM200CA6NKL6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM200CA6NKL6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM200CA6NKL6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM200CA6NKL6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM200CA6NKL6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM200CA6NKL6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM200CA6NKL6 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM200CA6NKL6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM200CA6NKL6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM200CA6NKL6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM200CA6NKL6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM200CA6NKL6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM200CA6NKL6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM200CA6NKL6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM200CA6NKL6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM200CA6NKL6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM200CA6NKL6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM200CA6NKL6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM200CA6NKL6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM200CA6NKL6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM200CA6NKL6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM200CA6NKL6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM200CA6NKL6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM200CA6NKL6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM200CA6NKL6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM200CA6NKL6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM200CA6NKL6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM200CA6NKL6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms