Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SERINC4A6NH21 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SERINC4A6NH21 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SERINC4A6NH21 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SERINC4A6NH21 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SERINC4A6NH21 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SERINC4A6NH21 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SERINC4A6NH21 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SERINC4A6NH21 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SERINC4A6NH21 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SERINC4A6NH21 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SERINC4A6NH21 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SERINC4A6NH21 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SERINC4A6NH21 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SERINC4A6NH21 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms