Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms