Protein–RNA interactions for Protein: A6NDD5

SYNDIG1L, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1LA6NDD5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYNDIG1LA6NDD5 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms