Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PALM3A6NDB9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms