Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL33A6NCF5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms