Protein–RNA interactions for Protein: A4D1U4

LCHN, Protein LCHN, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCHNA4D1U4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCHNA4D1U4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCHNA4D1U4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCHNA4D1U4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms