Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E2F8A0AVK6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms