Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6H5

TRBV20OR9-2, T-cell receptor beta variable 20/OR9-2 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms