Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 CCDC18-AS1-218ENST00000450843 600 ntTSL 56.28□□□□□ -1.43e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 PFN2-209ENST00000481275 560 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.426e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 CCDC18-AS1-212ENST00000440778 596 ntTSL 56.05□□□□□ -1.443e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 KDM5A-202ENST00000535014 551 ntTSL 45.83□□□□□ -1.486e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 CCDC18-AS1-216ENST00000447577 431 ntTSL 55.39□□□□□ -1.553e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 SNHG16-206ENST00000587838 884 ntTSL 34.06□□□□□ -1.761e-10■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 COPB2-203ENST00000503326 433 ntTSL 33.23□□□□□ -1.896e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 WIPI1-209ENST00000591494 828 ntTSL 52.69□□□□□ -1.986e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 PLIN3-206ENST00000589494 629 ntTSL 518.28■□□□□ 0.522e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 PLIN3-204ENST00000589034 574 ntTSL 517.18■□□□□ 0.342e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.12e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.052e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 PLIN3-201ENST00000221957 2333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.182e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 DRAM2-208ENST00000484310 1872 ntTSL 1 (best)24.94■■□□□ 1.584e-11■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.574e-11■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.134e-11■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 DRAM2-203ENST00000462092 802 ntTSL 211.82□□□□□ -0.524e-11■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 SEPT2-235ENST00000475823 371 ntTSL 310.43□□□□□ -0.744e-11■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 DRAM2-204ENST00000463682 688 ntTSL 38.83□□□□□ -14e-11■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 SEPT2-202ENST00000366210 672 ntTSL 38.5□□□□□ -1.054e-11■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 DRAM2-209ENST00000490780 769 ntTSL 25.97□□□□□ -1.454e-11■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 DRAM2-210ENST00000496430 767 ntTSL 54.91□□□□□ -1.624e-11■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 DTL-204ENST00000489149 815 ntTSL 24.44□□□□□ -1.74e-11■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 CD46-213ENST00000471987 572 ntTSL 33.76□□□□□ -1.814e-11■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 CD46-216ENST00000490278 747 ntTSL 23.42□□□□□ -1.864e-11■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 CD46-215ENST00000488596 872 ntTSL 32.79□□□□□ -1.964e-11■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 DRAM2-207ENST00000480600 533 ntTSL 52.78□□□□□ -1.964e-11■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 CD46-219ENST00000636114 2098 ntTSL 52.57□□□□□ -24e-11■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 CD46-210ENST00000462968 473 ntTSL 32.46□□□□□ -2.024e-11■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 FNBP4-202ENST00000524696 481 ntTSL 312.9□□□□□ -0.341e-6■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 FNBP4-210ENST00000531394 605 ntTSL 311□□□□□ -0.651e-6■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 FNBP4-204ENST00000525792 840 ntTSL 38.49□□□□□ -1.051e-6■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 STAT3-214ENST00000590776 1483 nt17.73■□□□□ 0.434e-7■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 STAT3-212ENST00000588065 571 ntTSL 414.01□□□□□ -0.174e-7■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 PPP1R35-203ENST00000476185 474 ntTSL 219.67■□□□□ 0.749e-7■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 SNHG16-208ENST00000591956 556 ntTSL 210.88□□□□□ -0.675e-7■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 SNHG16-201ENST00000448136 3607 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.75e-7■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 SNHG16-204ENST00000586942 568 ntTSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.795e-7■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 SNHG16-207ENST00000590435 1947 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.865e-7■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 SNHG16-202ENST00000493536 2424 ntTSL 1 (best)8.97□□□□□ -0.975e-7■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 RRM2-206ENST00000474701 1060 ntTSL 213.51□□□□□ -0.254e-6■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 SNHG16-205ENST00000587743 2665 nt16.77■□□□□ 0.287e-7■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 SNHG16-203ENST00000586846 582 ntTSL 416.67■□□□□ 0.267e-7■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 TFG-207ENST00000487505 913 ntTSL 318.34■□□□□ 0.539e-7■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 CDV3-205ENST00000504867 471 ntTSL 316.99■□□□□ 0.311e-10■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 BUD23-214ENST00000464615 458 ntTSL 516.6■□□□□ 0.259e-7■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.24e-12■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 TAL1-206ENST00000481091 504 ntTSL 314.44□□□□□ -0.19e-7■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.111e-10■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 UCP2-207ENST00000543714 567 ntTSL 213.49□□□□□ -0.259e-7■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 MYO18B-202ENST00000407587 8090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.283e-9■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 NUP62CL-204ENST00000484614 1515 ntTSL 212.63□□□□□ -0.391e-10■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 MYO18B-201ENST00000335473 8565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.393e-9■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 MYO18B-205ENST00000536101 8051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.523e-9■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 XPO7-202ENST00000433566 4519 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.569e-7■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 UCP2-203ENST00000539330 608 ntTSL 210.58□□□□□ -0.729e-7■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 UCP2-205ENST00000541027 536 ntTSL 410.58□□□□□ -0.729e-7■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 UCP2-206ENST00000542615 538 ntTSL 310.58□□□□□ -0.729e-7■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 BAZ2A-209ENST00000549763 657 ntTSL 39.55□□□□□ -0.889e-7■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 TMEM135-202ENST00000340353 3938 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.124e-12■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 BAZ2A-205ENST00000547650 614 ntTSL 38.03□□□□□ -1.129e-7■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 TMEM135-201ENST00000305494 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.294e-12■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 CDKAL1-204ENST00000613575 1673 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.329e-7■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.429e-7■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 ATF2-215ENST00000435004 1115 ntTSL 55.7□□□□□ -1.59e-7■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 XPO7-203ENST00000517551 883 ntTSL 54.51□□□□□ -1.699e-7■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.889e-7■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.919e-7■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 ATF2-220ENST00000478905 697 ntTSL 32.94□□□□□ -1.949e-7■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.451e-24■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 TFRC-215ENST00000491658 396 ntTSL 53.11□□□□□ -1.911e-20■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 EML4-205ENST00000409040 962 ntTSL 1 (best)15.68■□□□□ 0.15e-15■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 RPL10-208ENST00000449494 622 ntTSL 514.72□□□□□ -0.054e-19■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 RPL10-205ENST00000427682 457 ntTSL 59.93□□□□□ -0.824e-19■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 RPL10-206ENST00000428169 292 ntTSL 59.18□□□□□ -0.944e-19■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 CREBZF-206ENST00000528561 1099 ntTSL 519.28■□□□□ 0.681e-12■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 CREBZF-203ENST00000525639 2850 ntTSL 519.03■□□□□ 0.641e-12■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 CREBZF-201ENST00000260058 1431 ntTSL 216.62■□□□□ 0.251e-12■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 CREBZF-202ENST00000490820 4329 ntTSL 1 (best)14.81□□□□□ -0.041e-12■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 CREBZF-205ENST00000527529 898 ntTSL 514.54□□□□□ -0.081e-12■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.151e-12■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 CREBZF-208ENST00000531515 724 ntTSL 313.25□□□□□ -0.291e-12■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 CREBZF-207ENST00000528889 745 ntTSL 37.44□□□□□ -1.221e-12■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.431e-12■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 MLXIPL-208ENST00000456640 706 ntTSL 516.64■□□□□ 0.252e-18■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.89■□□□□ 0.935e-8■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.895e-8■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.885e-8■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.715e-8■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.595e-8■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 TPD52L1-212ENST00000532978 2489 ntTSL 218.1■□□□□ 0.495e-8■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.485e-8■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.275e-8■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 CYBRD1-207ENST00000494587 549 ntTSL 416.68■□□□□ 0.265e-8■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.25e-8■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.155e-8■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 BAG1-203ENST00000379707 1396 ntTSL 1 (best)15.85■□□□□ 0.135e-8■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 CYBRD1-205ENST00000468308 763 ntTSL 315.57■□□□□ 0.085e-8■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 BAG1-207ENST00000473781 681 ntTSL 315.1■□□□□ 0.015e-8■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.085e-8■□□□□ 10.4
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