Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 TAPT1-217ENST00000513833 431 ntTSL 35.19□□□□□ -1.585e-6■□□□□ 9.5
SF3B4Q15427 TAPT1-205ENST00000505152 740 ntTSL 55.03□□□□□ -1.65e-6■□□□□ 9.5
SF3B4Q15427 BRWD1-215ENST00000491564 522 ntTSL 1 (best)4.26□□□□□ -1.735e-6■□□□□ 9.5
SF3B4Q15427 PLK4-205ENST00000508113 596 ntTSL 36.5□□□□□ -1.377e-7■□□□□ 9.5
SF3B4Q15427 MARCH6-213ENST00000514961 703 ntTSL 55.91□□□□□ -1.465e-12■□□□□ 9.5
SF3B4Q15427 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC3.68□□□□□ -1.825e-34■□□□□ 9.5
SF3B4Q15427 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC3□□□□□ -1.935e-34■□□□□ 9.5
SF3B4Q15427 SLC9A8-204ENST00000490250 4942 ntTSL 212.96□□□□□ -0.341e-6■□□□□ 9.5
SF3B4Q15427 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.341e-6■□□□□ 9.5
SF3B4Q15427 SLC9A8-202ENST00000417961 6309 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.711e-6■□□□□ 9.5
SF3B4Q15427 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.244e-7■□□□□ 9.5
SF3B4Q15427 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.014e-7■□□□□ 9.5
SF3B4Q15427 PDIA6-204ENST00000404824 2236 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.534e-7■□□□□ 9.5
SF3B4Q15427 PDIA6-208ENST00000617249 2344 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.564e-7■□□□□ 9.5
SF3B4Q15427 PDIA6-202ENST00000381611 2534 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.694e-7■□□□□ 9.5
SF3B4Q15427 PDIA6-203ENST00000404371 2682 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.754e-7■□□□□ 9.5
SF3B4Q15427 PSMA7-205ENST00000484488 1023 ntTSL 321.52■■□□□ 1.048e-8■□□□□ 9.5
SF3B4Q15427 PPP1CC-211ENST00000620030 582 ntTSL 221.44■■□□□ 1.028e-8■□□□□ 9.5
SF3B4Q15427 ATP6V0A1-220ENST00000588901 589 ntTSL 216.29■□□□□ 0.23e-7■□□□□ 9.5
SF3B4Q15427 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.118e-8■□□□□ 9.5
SF3B4Q15427 PSMA7-204ENST00000442551 685 ntTSL 313.52□□□□□ -0.258e-8■□□□□ 9.5
SF3B4Q15427 TRIM27-207ENST00000498117 728 ntTSL 311.68□□□□□ -0.548e-8■□□□□ 9.5
SF3B4Q15427 BUB1-203ENST00000420328 566 ntTSL 511.31□□□□□ -0.61e-14■□□□□ 9.5
SF3B4Q15427 PSMA7-202ENST00000370861 773 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.648e-8■□□□□ 9.5
SF3B4Q15427 ZFP91-CNTF-202ENST00000422974 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 59.88□□□□□ -0.838e-8■□□□□ 9.5
SF3B4Q15427 PRPF3-203ENST00000467514 1097 ntTSL 39.83□□□□□ -0.848e-8■□□□□ 9.5
SF3B4Q15427 UBE2Q2P1-207ENST00000561403 364 ntTSL 57.92□□□□□ -1.148e-8■□□□□ 9.5
SF3B4Q15427 DROSHA-215ENST00000512076 1124 ntTSL 1 (best)7.62□□□□□ -1.198e-8■□□□□ 9.5
SF3B4Q15427 BUB1-205ENST00000447014 551 ntTSL 46.45□□□□□ -1.381e-14■□□□□ 9.5
SF3B4Q15427 UBE2Q2P1-203ENST00000558251 595 ntTSL 35.89□□□□□ -1.478e-8■□□□□ 9.5
SF3B4Q15427 RHOBTB3-202ENST00000502541 693 ntTSL 55.46□□□□□ -1.541e-14■□□□□ 9.5
SF3B4Q15427 IFRD1-214ENST00000486688 567 ntTSL 45.02□□□□□ -1.618e-8■□□□□ 9.5
SF3B4Q15427 USP9X-205ENST00000465386 479 ntTSL 24.95□□□□□ -1.628e-8■□□□□ 9.5
SF3B4Q15427 BUB1-204ENST00000436916 540 ntTSL 44.55□□□□□ -1.681e-14■□□□□ 9.5
SF3B4Q15427 PSMA7-206ENST00000486193 548 ntTSL 24.12□□□□□ -1.758e-8■□□□□ 9.5
SF3B4Q15427 RHBG-209ENST00000622297 720 ntTSL 512.58□□□□□ -0.43e-21■□□□□ 9.5
SF3B4Q15427 RHBG-203ENST00000494874 324 ntTSL 38.81□□□□□ -13e-21■□□□□ 9.5
SF3B4Q15427 PHF14-214ENST00000521747 2479 ntTSL 220.84■□□□□ 0.937e-6■□□□□ 9.4
SF3B4Q15427 PHF14-202ENST00000423760 2627 ntTSL 220.62■□□□□ 0.897e-6■□□□□ 9.4
SF3B4Q15427 DDX39A-205ENST00000586993 585 ntTSL 420.09■□□□□ 0.817e-6■□□□□ 9.4
SF3B4Q15427 DDX39A-215ENST00000590696 563 ntTSL 419.89■□□□□ 0.777e-6■□□□□ 9.4
SF3B4Q15427 CCDC12-207ENST00000494655 793 ntTSL 218.94■□□□□ 0.627e-6■□□□□ 9.4
SF3B4Q15427 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.497e-6■□□□□ 9.4
SF3B4Q15427 MARCH3-202ENST00000502289 764 ntTSL 417.71■□□□□ 0.437e-6■□□□□ 9.4
SF3B4Q15427 CEP131-206ENST00000571292 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 317.54■□□□□ 0.47e-6■□□□□ 9.4
SF3B4Q15427 CEP131-205ENST00000570817 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)17■□□□□ 0.317e-6■□□□□ 9.4
SF3B4Q15427 POFUT2-209ENST00000476653 598 ntTSL 216.86■□□□□ 0.297e-6■□□□□ 9.4
SF3B4Q15427 CCDC12-213ENST00000605875 380 ntTSL 516.57■□□□□ 0.247e-6■□□□□ 9.4
SF3B4Q15427 CCDC12-205ENST00000488069 897 ntTSL 216.53■□□□□ 0.247e-6■□□□□ 9.4
SF3B4Q15427 CCDC12-208ENST00000603885 560 ntTSL 316.53■□□□□ 0.247e-6■□□□□ 9.4
SF3B4Q15427 BAIAP3-211ENST00000566389 841 ntTSL 316.33■□□□□ 0.27e-6■□□□□ 9.4
SF3B4Q15427 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.197e-6■□□□□ 9.4
SF3B4Q15427 BAIAP3-208ENST00000564213 334 ntTSL 315.89■□□□□ 0.137e-6■□□□□ 9.4
SF3B4Q15427 PHF14-210ENST00000490957 4058 ntTSL 515.48■□□□□ 0.077e-6■□□□□ 9.4
SF3B4Q15427 CCDC12-210ENST00000604181 550 ntTSL 415.3■□□□□ 0.047e-6■□□□□ 9.4
SF3B4Q15427 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.037e-6■□□□□ 9.4
SF3B4Q15427 SYMPK-204ENST00000593959 546 ntTSL 415.01□□□□□ -0.017e-6■□□□□ 9.4
SF3B4Q15427 DDX39A-216ENST00000591275 484 ntTSL 214.55□□□□□ -0.087e-6■□□□□ 9.4
SF3B4Q15427 TRIP12-215ENST00000479037 2938 ntTSL 1 (best)14.44□□□□□ -0.17e-6■□□□□ 9.4
SF3B4Q15427 BAIAP3-206ENST00000561793 571 ntTSL 414.38□□□□□ -0.117e-6■□□□□ 9.4
SF3B4Q15427 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.137e-6■□□□□ 9.4
SF3B4Q15427 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.247e-6■□□□□ 9.4
SF3B4Q15427 DDX39A-211ENST00000590239 565 ntTSL 413.55□□□□□ -0.247e-6■□□□□ 9.4
SF3B4Q15427 MARCH3-201ENST00000308660 4196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.447e-6■□□□□ 9.4
SF3B4Q15427 RBM28-208ENST00000495327 395 ntTSL 212.14□□□□□ -0.477e-6■□□□□ 9.4
SF3B4Q15427 SERPINF1-203ENST00000570820 820 ntTSL 212.09□□□□□ -0.477e-6■□□□□ 9.4
SF3B4Q15427 DDX39A-218ENST00000592632 586 ntTSL 211.73□□□□□ -0.537e-6■□□□□ 9.4
SF3B4Q15427 DOCK6-202ENST00000585609 3152 ntTSL 211.57□□□□□ -0.567e-6■□□□□ 9.4
SF3B4Q15427 CCDC12-209ENST00000604164 399 ntTSL 310.6□□□□□ -0.717e-6■□□□□ 9.4
SF3B4Q15427 MARCH3-205ENST00000515241 719 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.747e-6■□□□□ 9.4
SF3B4Q15427 CCDC12-203ENST00000446836 412 ntTSL 39.88□□□□□ -0.837e-6■□□□□ 9.4
SF3B4Q15427 CCDC12-204ENST00000460035 572 ntTSL 29.8□□□□□ -0.847e-6■□□□□ 9.4
SF3B4Q15427 ADAT2-201ENST00000237283 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.917e-6■□□□□ 9.4
SF3B4Q15427 DOCK6-204ENST00000586482 352 ntTSL 39.2□□□□□ -0.947e-6■□□□□ 9.4
SF3B4Q15427 DDX39A-220ENST00000593008 538 ntTSL 38.66□□□□□ -1.027e-6■□□□□ 9.4
SF3B4Q15427 SYMPK-217ENST00000601600 560 ntTSL 48.64□□□□□ -1.037e-6■□□□□ 9.4
SF3B4Q15427 COX6C-202ENST00000517682 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.057e-6■□□□□ 9.4
SF3B4Q15427 COX6C-201ENST00000297564 433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.12□□□□□ -1.117e-6■□□□□ 9.4
SF3B4Q15427 COX6C-203ENST00000518171 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.12□□□□□ -1.117e-6■□□□□ 9.4
SF3B4Q15427 LARS-214ENST00000512412 575 ntTSL 56.97□□□□□ -1.294e-7■□□□□ 9.4
SF3B4Q15427 XPO1-213ENST00000460037 573 ntTSL 46.62□□□□□ -1.357e-6■□□□□ 9.4
SF3B4Q15427 COX6C-207ENST00000522934 562 ntTSL 46.55□□□□□ -1.367e-6■□□□□ 9.4
SF3B4Q15427 COX6C-205ENST00000520468 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.367e-6■□□□□ 9.4
SF3B4Q15427 PHF14-208ENST00000481418 792 ntTSL 36.52□□□□□ -1.377e-6■□□□□ 9.4
SF3B4Q15427 COX6C-209ENST00000523016 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.377e-6■□□□□ 9.4
SF3B4Q15427 RBM28-205ENST00000481788 1052 ntTSL 36.02□□□□□ -1.457e-6■□□□□ 9.4
SF3B4Q15427 PHF14-209ENST00000489305 471 ntTSL 35.87□□□□□ -1.477e-6■□□□□ 9.4
SF3B4Q15427 DUSP11-205ENST00000480948 787 ntTSL 55.67□□□□□ -1.57e-6■□□□□ 9.4
SF3B4Q15427 COX6C-206ENST00000520517 566 ntTSL 45.2□□□□□ -1.587e-6■□□□□ 9.4
SF3B4Q15427 MED13L-207ENST00000551197 489 ntTSL 55.02□□□□□ -1.617e-6■□□□□ 9.4
SF3B4Q15427 RAD21-203ENST00000517749 1003 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.637e-6■□□□□ 9.4
SF3B4Q15427 DUSP11-204ENST00000477458 588 ntTSL 54.84□□□□□ -1.637e-6■□□□□ 9.4
SF3B4Q15427 CENPJ-202ENST00000418179 691 ntTSL 1 (best)4.73□□□□□ -1.657e-6■□□□□ 9.4
SF3B4Q15427 PHF14-204ENST00000470665 1005 ntTSL 24.27□□□□□ -1.737e-6■□□□□ 9.4
SF3B4Q15427 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC4.14□□□□□ -1.757e-6■□□□□ 9.4
SF3B4Q15427 PHF14-213ENST00000498784 718 ntTSL 24.05□□□□□ -1.767e-6■□□□□ 9.4
SF3B4Q15427 KDM2A-208ENST00000527157 574 ntTSL 23.69□□□□□ -1.827e-6■□□□□ 9.4
SF3B4Q15427 ADAT2-202ENST00000367593 524 ntTSL 33.65□□□□□ -1.837e-6■□□□□ 9.4
SF3B4Q15427 DCAF7-203ENST00000580091 325 ntTSL 39.02□□□□□ -0.971e-10■□□□□ 9.4
SF3B4Q15427 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.248e-9■□□□□ 9.4
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