Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 NBEAL2-208ENST00000475689 677 ntTSL 220.1■□□□□ 0.811e-8■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 CTSB-206ENST00000524500 573 ntTSL 420.03■□□□□ 0.81e-8■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.81e-8■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.81e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.781e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 PKD1-223ENST00000561668 665 ntTSL 319.89■□□□□ 0.771e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.771e-8■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.771e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.741e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 RGS14-211ENST00000512490 565 ntTSL 219.67■□□□□ 0.741e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.741e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 UNC45A-206ENST00000486253 1507 ntTSL 219.61■□□□□ 0.731e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 PAIP2-204ENST00000507755 776 ntTSL 519.6■□□□□ 0.731e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 PRPF40A-209ENST00000486100 569 ntTSL 419.55■□□□□ 0.721e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 STXBP2-205ENST00000593854 704 ntTSL 219.55■□□□□ 0.721e-8■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 NAA10-210ENST00000467451 743 ntTSL 219.54■□□□□ 0.724e-7■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.711e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.711e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.711e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 CCHCR1-223ENST00000507751 588 ntTSL 219.46■□□□□ 0.711e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 ISCU-207ENST00000539580 1169 ntTSL 1 (best)19.46■□□□□ 0.711e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 PKD1-227ENST00000564313 568 ntTSL 419.46■□□□□ 0.711e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.71e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 UNC45A-215ENST00000557212 1528 ntTSL 219.34■□□□□ 0.691e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.671e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 GTPBP3-226ENST00000601983 541 ntTSL 419.24■□□□□ 0.671e-8■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.661e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 CCHCR1-216ENST00000502557 662 ntTSL 319.11■□□□□ 0.651e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 CCHCR1-221ENST00000507226 544 ntTSL 419.11■□□□□ 0.651e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.641e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 ISCU-213ENST00000552072 738 ntTSL 219.03■□□□□ 0.641e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 MORF4L1-220ENST00000559930 678 ntTSL 419.01■□□□□ 0.631e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 DYRK2-201ENST00000319833 566 ntTSL 318.93■□□□□ 0.621e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 TNNI3-202ENST00000585806 699 ntTSL 218.87■□□□□ 0.611e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 ZNF487-204ENST00000456416 567 ntTSL 418.74■□□□□ 0.591e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 ZNF598-201ENST00000561787 786 ntTSL 318.73■□□□□ 0.593e-12■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 TMEM131L-204ENST00000445960 538 ntTSL 418.69■□□□□ 0.582e-10■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.581e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.571e-8■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 ISCU-204ENST00000535405 819 ntTSL 218.62■□□□□ 0.571e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.571e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.57■□□□□ 0.561e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 STUB1-208ENST00000566408 684 ntTSL 218.54■□□□□ 0.561e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 GABBR1-220ENST00000494877 2364 ntTSL 518.54■□□□□ 0.561e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.531e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 CDCA2-203ENST00000518225 464 ntTSL 518.35■□□□□ 0.532e-10■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 INF2-206ENST00000477497 545 ntTSL 318.33■□□□□ 0.521e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.521e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 UBAC2-201ENST00000355700 748 ntTSL 318.26■□□□□ 0.511e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.51e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 FGFR4-210ENST00000508139 720 ntTSL 518.17■□□□□ 0.51e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.51e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 CTSB-226ENST00000532656 573 ntTSL 418.12■□□□□ 0.491e-8■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 KIAA1324L-210ENST00000474609 617 ntTSL 318.06■□□□□ 0.481e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 DCTD-203ENST00000500813 1829 ntTSL 218.06■□□□□ 0.481e-8■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 FAM32A-203ENST00000587351 401 ntTSL 518.05■□□□□ 0.481e-8■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 MIEN1-203ENST00000474210 706 ntTSL 217.98■□□□□ 0.471e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.461e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.461e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 ANKRD27-206ENST00000588700 773 ntTSL 517.93■□□□□ 0.461e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.441e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 NEDD4-212ENST00000557845 374 ntTSL 217.77■□□□□ 0.441e-8■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.431e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.421e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 ANKRD27-202ENST00000586463 743 ntTSL 517.69■□□□□ 0.421e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 CYHR1-208ENST00000528663 5821 ntTSL 1 (best)17.68■□□□□ 0.421e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 CORO7-214ENST00000572153 548 ntTSL 417.67■□□□□ 0.422e-10■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.421e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 DGCR6L-203ENST00000443409 935 ntTSL 1 (best)17.59■□□□□ 0.411e-8■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 UNC45A-210ENST00000553671 855 ntTSL 317.59■□□□□ 0.411e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.41e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 ZNF487-205ENST00000490208 583 ntTSL 217.45■□□□□ 0.381e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 STXBP2-215ENST00000599558 385 ntTSL 217.44■□□□□ 0.381e-8■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 CYHR1-211ENST00000533173 6158 ntTSL 1 (best)17.42■□□□□ 0.381e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 TNNI3-208ENST00000589864 525 ntTSL 217.37■□□□□ 0.371e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.371e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.351e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 RAI1-206ENST00000583166 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 217.2■□□□□ 0.341e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 RGS14-210ENST00000512000 559 ntTSL 317.16■□□□□ 0.341e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 CTSB-213ENST00000527215 545 ntTSL 417.14■□□□□ 0.331e-8■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 CORO7-228ENST00000575850 666 ntTSL 517.13■□□□□ 0.332e-10■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 RHCE-207ENST00000495048 592 ntTSL 217.04■□□□□ 0.321e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.321e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 DNAJB4-205ENST00000484662 906 ntTSL 217.02■□□□□ 0.321e-8■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.311e-8■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 BLMH-202ENST00000577290 586 ntTSL 417■□□□□ 0.311e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.311e-8■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 AHSA1-206ENST00000555457 641 ntTSL 316.98■□□□□ 0.311e-8■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 AHSA1-209ENST00000555729 621 ntTSL 316.98■□□□□ 0.311e-8■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 AHSA1-213ENST00000557476 584 ntTSL 316.98■□□□□ 0.311e-8■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.291e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 CORO7-218ENST00000572898 593 ntTSL 316.86■□□□□ 0.292e-10■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.291e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.281e-8■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.281e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.271e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.271e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 RGS14-213ENST00000514713 817 ntTSL 1 (best)16.71■□□□□ 0.271e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 RHCE-210ENST00000533771 581 ntTSL 316.7■□□□□ 0.261e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 PAIP2-207ENST00000511381 365 ntTSL 516.61■□□□□ 0.251e-6■■■■■ 38.5
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 4056.5 ms