Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GTF3C3Q9Y5Q9 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GTF3C3Q9Y5Q9 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GTF3C3Q9Y5Q9 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GTF3C3Q9Y5Q9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GTF3C3Q9Y5Q9 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GTF3C3Q9Y5Q9 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GTF3C3Q9Y5Q9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GTF3C3Q9Y5Q9 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GTF3C3Q9Y5Q9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GTF3C3Q9Y5Q9 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GTF3C3Q9Y5Q9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GTF3C3Q9Y5Q9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GTF3C3Q9Y5Q9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GTF3C3Q9Y5Q9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GTF3C3Q9Y5Q9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GTF3C3Q9Y5Q9 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GTF3C3Q9Y5Q9 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GTF3C3Q9Y5Q9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GTF3C3Q9Y5Q9 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GTF3C3Q9Y5Q9 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GTF3C3Q9Y5Q9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GTF3C3Q9Y5Q9 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GTF3C3Q9Y5Q9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GTF3C3Q9Y5Q9 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GTF3C3Q9Y5Q9 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GTF3C3Q9Y5Q9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GTF3C3Q9Y5Q9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GTF3C3Q9Y5Q9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GTF3C3Q9Y5Q9 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GTF3C3Q9Y5Q9 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GTF3C3Q9Y5Q9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GTF3C3Q9Y5Q9 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GTF3C3Q9Y5Q9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GTF3C3Q9Y5Q9 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GTF3C3Q9Y5Q9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GTF3C3Q9Y5Q9 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GTF3C3Q9Y5Q9 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GTF3C3Q9Y5Q9 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GTF3C3Q9Y5Q9 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
GTF3C3Q9Y5Q9 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GTF3C3Q9Y5Q9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GTF3C3Q9Y5Q9 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GTF3C3Q9Y5Q9 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GTF3C3Q9Y5Q9 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GTF3C3Q9Y5Q9 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GTF3C3Q9Y5Q9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GTF3C3Q9Y5Q9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
GTF3C3Q9Y5Q9 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GTF3C3Q9Y5Q9 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GTF3C3Q9Y5Q9 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GTF3C3Q9Y5Q9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GTF3C3Q9Y5Q9 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GTF3C3Q9Y5Q9 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GTF3C3Q9Y5Q9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GTF3C3Q9Y5Q9 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GTF3C3Q9Y5Q9 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GTF3C3Q9Y5Q9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GTF3C3Q9Y5Q9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GTF3C3Q9Y5Q9 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
GTF3C3Q9Y5Q9 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GTF3C3Q9Y5Q9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GTF3C3Q9Y5Q9 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GTF3C3Q9Y5Q9 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GTF3C3Q9Y5Q9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GTF3C3Q9Y5Q9 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GTF3C3Q9Y5Q9 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GTF3C3Q9Y5Q9 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GTF3C3Q9Y5Q9 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GTF3C3Q9Y5Q9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GTF3C3Q9Y5Q9 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GTF3C3Q9Y5Q9 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GTF3C3Q9Y5Q9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GTF3C3Q9Y5Q9 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GTF3C3Q9Y5Q9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GTF3C3Q9Y5Q9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GTF3C3Q9Y5Q9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GTF3C3Q9Y5Q9 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GTF3C3Q9Y5Q9 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GTF3C3Q9Y5Q9 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GTF3C3Q9Y5Q9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GTF3C3Q9Y5Q9 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GTF3C3Q9Y5Q9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
GTF3C3Q9Y5Q9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
GTF3C3Q9Y5Q9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
GTF3C3Q9Y5Q9 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GTF3C3Q9Y5Q9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GTF3C3Q9Y5Q9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GTF3C3Q9Y5Q9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GTF3C3Q9Y5Q9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GTF3C3Q9Y5Q9 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms