Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E7

PCDHB2, Protocadherin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB2Q9Y5E7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDHB2Q9Y5E7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCDHB2Q9Y5E7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCDHB2Q9Y5E7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCDHB2Q9Y5E7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCDHB2Q9Y5E7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCDHB2Q9Y5E7 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCDHB2Q9Y5E7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCDHB2Q9Y5E7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCDHB2Q9Y5E7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCDHB2Q9Y5E7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms