Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PAXBP1Q9Y5B6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PAXBP1Q9Y5B6 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PAXBP1Q9Y5B6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PAXBP1Q9Y5B6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PAXBP1Q9Y5B6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PAXBP1Q9Y5B6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PAXBP1Q9Y5B6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PAXBP1Q9Y5B6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PAXBP1Q9Y5B6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PAXBP1Q9Y5B6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PAXBP1Q9Y5B6 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PAXBP1Q9Y5B6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PAXBP1Q9Y5B6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PAXBP1Q9Y5B6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PAXBP1Q9Y5B6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PAXBP1Q9Y5B6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PAXBP1Q9Y5B6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PAXBP1Q9Y5B6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PAXBP1Q9Y5B6 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PAXBP1Q9Y5B6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PAXBP1Q9Y5B6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAXBP1Q9Y5B6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAXBP1Q9Y5B6 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAXBP1Q9Y5B6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAXBP1Q9Y5B6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAXBP1Q9Y5B6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAXBP1Q9Y5B6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAXBP1Q9Y5B6 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAXBP1Q9Y5B6 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAXBP1Q9Y5B6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAXBP1Q9Y5B6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAXBP1Q9Y5B6 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAXBP1Q9Y5B6 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAXBP1Q9Y5B6 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PAXBP1Q9Y5B6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PAXBP1Q9Y5B6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PAXBP1Q9Y5B6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PAXBP1Q9Y5B6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PAXBP1Q9Y5B6 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PAXBP1Q9Y5B6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PAXBP1Q9Y5B6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PAXBP1Q9Y5B6 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAXBP1Q9Y5B6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAXBP1Q9Y5B6 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms