Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B6

DCAF1, DDB1- and CUL4-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF1Q9Y4B6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
DCAF1Q9Y4B6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
DCAF1Q9Y4B6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC41.15■■■■■ 4.18
DCAF1Q9Y4B6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC41.15■■■■■ 4.18
DCAF1Q9Y4B6 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
DCAF1Q9Y4B6 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC41.14■■■■■ 4.18
DCAF1Q9Y4B6 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC41.14■■■■■ 4.18
DCAF1Q9Y4B6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
DCAF1Q9Y4B6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
DCAF1Q9Y4B6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC41.14■■■■■ 4.18
DCAF1Q9Y4B6 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.18
DCAF1Q9Y4B6 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.18
DCAF1Q9Y4B6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC41.13■■■■■ 4.18
DCAF1Q9Y4B6 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC41.13■■■■■ 4.18
DCAF1Q9Y4B6 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.18
DCAF1Q9Y4B6 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.13■■■■■ 4.18
DCAF1Q9Y4B6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC41.13■■■■■ 4.18
DCAF1Q9Y4B6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
DCAF1Q9Y4B6 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.13■■■■■ 4.17
DCAF1Q9Y4B6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC41.13■■■■■ 4.17
DCAF1Q9Y4B6 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
DCAF1Q9Y4B6 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC41.13■■■■■ 4.17
DCAF1Q9Y4B6 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC41.13■■■■■ 4.17
DCAF1Q9Y4B6 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC41.13■■■■■ 4.17
DCAF1Q9Y4B6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
DCAF1Q9Y4B6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
DCAF1Q9Y4B6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC41.12■■■■■ 4.17
DCAF1Q9Y4B6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC41.12■■■■■ 4.17
DCAF1Q9Y4B6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.12■■■■■ 4.17
DCAF1Q9Y4B6 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
DCAF1Q9Y4B6 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC41.12■■■■■ 4.17
DCAF1Q9Y4B6 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC41.12■■■■■ 4.17
DCAF1Q9Y4B6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.11■■■■■ 4.17
DCAF1Q9Y4B6 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC41.11■■■■■ 4.17
DCAF1Q9Y4B6 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC41.11■■■■■ 4.17
DCAF1Q9Y4B6 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
DCAF1Q9Y4B6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
DCAF1Q9Y4B6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
DCAF1Q9Y4B6 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC41.1■■■■■ 4.17
DCAF1Q9Y4B6 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
DCAF1Q9Y4B6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC41.1■■■■■ 4.17
DCAF1Q9Y4B6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC41.09■■■■■ 4.17
DCAF1Q9Y4B6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
DCAF1Q9Y4B6 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC41.09■■■■■ 4.17
DCAF1Q9Y4B6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.09■■■■■ 4.17
DCAF1Q9Y4B6 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC41.09■■■■■ 4.17
DCAF1Q9Y4B6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
DCAF1Q9Y4B6 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
DCAF1Q9Y4B6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
DCAF1Q9Y4B6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.09■■■■■ 4.17
DCAF1Q9Y4B6 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC41.08■■■■■ 4.17
DCAF1Q9Y4B6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
DCAF1Q9Y4B6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC41.08■■■■■ 4.17
DCAF1Q9Y4B6 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
DCAF1Q9Y4B6 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
DCAF1Q9Y4B6 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC41.08■■■■■ 4.17
DCAF1Q9Y4B6 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC41.08■■■■■ 4.17
DCAF1Q9Y4B6 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
DCAF1Q9Y4B6 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC41.07■■■■■ 4.16
DCAF1Q9Y4B6 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
DCAF1Q9Y4B6 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC41.07■■■■■ 4.16
DCAF1Q9Y4B6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
DCAF1Q9Y4B6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
DCAF1Q9Y4B6 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC41.06■■■■■ 4.16
DCAF1Q9Y4B6 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC41.06■■■■■ 4.16
DCAF1Q9Y4B6 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
DCAF1Q9Y4B6 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
DCAF1Q9Y4B6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
DCAF1Q9Y4B6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
DCAF1Q9Y4B6 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
DCAF1Q9Y4B6 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC41.04■■■■■ 4.16
DCAF1Q9Y4B6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
DCAF1Q9Y4B6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
DCAF1Q9Y4B6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC41.04■■■■■ 4.16
DCAF1Q9Y4B6 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.04■■■■■ 4.16
DCAF1Q9Y4B6 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC41.04■■■■■ 4.16
DCAF1Q9Y4B6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC41.03■■■■■ 4.16
DCAF1Q9Y4B6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC41.03■■■■■ 4.16
DCAF1Q9Y4B6 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
DCAF1Q9Y4B6 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC41.03■■■■■ 4.16
DCAF1Q9Y4B6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
DCAF1Q9Y4B6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
DCAF1Q9Y4B6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
DCAF1Q9Y4B6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.03■■■■■ 4.16
DCAF1Q9Y4B6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.03■■■■■ 4.16
DCAF1Q9Y4B6 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC41.03■■■■■ 4.16
DCAF1Q9Y4B6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
DCAF1Q9Y4B6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
DCAF1Q9Y4B6 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC41.03■■■■■ 4.16
DCAF1Q9Y4B6 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC41.03■■■■■ 4.16
DCAF1Q9Y4B6 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC41.03■■■■■ 4.16
DCAF1Q9Y4B6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
DCAF1Q9Y4B6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC41.02■■■■■ 4.16
DCAF1Q9Y4B6 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
DCAF1Q9Y4B6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
DCAF1Q9Y4B6 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC41.02■■■■■ 4.16
DCAF1Q9Y4B6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
DCAF1Q9Y4B6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
DCAF1Q9Y4B6 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC41.02■■■■■ 4.16
DCAF1Q9Y4B6 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms