Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3T6

R3HCC1, R3H and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1Q9Y3T6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
R3HCC1Q9Y3T6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms