Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q9Y3F1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q9Y3F1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q9Y3F1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q9Y3F1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q9Y3F1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q9Y3F1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Q9Y3F1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q9Y3F1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q9Y3F1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Q9Y3F1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q9Y3F1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q9Y3F1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q9Y3F1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q9Y3F1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q9Y3F1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q9Y3F1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q9Y3F1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q9Y3F1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q9Y3F1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q9Y3F1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q9Y3F1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q9Y3F1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q9Y3F1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q9Y3F1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q9Y3F1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q9Y3F1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q9Y3F1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q9Y3F1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q9Y3F1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q9Y3F1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q9Y3F1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q9Y3F1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q9Y3F1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q9Y3F1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q9Y3F1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q9Y3F1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q9Y3F1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q9Y3F1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q9Y3F1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q9Y3F1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q9Y3F1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q9Y3F1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Q9Y3F1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q9Y3F1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q9Y3F1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q9Y3F1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q9Y3F1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q9Y3F1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q9Y3F1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q9Y3F1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q9Y3F1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q9Y3F1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q9Y3F1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Q9Y3F1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Q9Y3F1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Q9Y3F1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q9Y3F1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q9Y3F1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q9Y3F1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q9Y3F1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q9Y3F1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q9Y3F1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Q9Y3F1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q9Y3F1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q9Y3F1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q9Y3F1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q9Y3F1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q9Y3F1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q9Y3F1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q9Y3F1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q9Y3F1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q9Y3F1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q9Y3F1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q9Y3F1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q9Y3F1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q9Y3F1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q9Y3F1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q9Y3F1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q9Y3F1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q9Y3F1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Q9Y3F1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q9Y3F1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q9Y3F1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q9Y3F1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q9Y3F1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q9Y3F1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q9Y3F1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q9Y3F1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q9Y3F1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q9Y3F1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q9Y3F1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q9Y3F1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q9Y3F1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q9Y3F1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q9Y3F1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q9Y3F1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q9Y3F1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q9Y3F1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q9Y3F1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms